Graphpad做单因素方差分析步骤详解

博主:xueyexueye 5年前 ( 2019-12-15 ) 7298 0条评论
方差分析就是对试验数据进行分析,检验方差相等的多个正态总体均值是否相等,进而判断各因素对试验指标的影响是否显著,根据影响试验指标条件的个数可以区分为单因素方差分析双因素方差分析多因素方差分析



试验中要考察的指标称为试验指标,影响试验指标的条件称为因素,因素所处的状态称为水平,若试验中只有一个因素改变则称为单因素试验,若有两个因素改变则称为双因素试验,若有多个因素改变则称为多因素试验

——《百度百科》

今天,我们就以动物行为学数据进行一下示范,因为影响因素只有药物,所以我们应该使用单因素方差进行分析的方法。

我们回顾一下进行单因素方差的基本步骤:
a. 对各个组数据进行正态性检验
b. 对各个组数据进行方差齐性检验

c. 进行各个组之间均值的比较(单因素方差分析)

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下面是我们的数据,我们首先进行数据的统计描述



 


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首先打开Graphpad软件,输入数据,更改组名,更改Data1为Total distance



 


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进行数据正态性检验:选中数据 – Analyze – Column analyses – Normality and Log normality Tests -选中组别-OK



 


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进行正态性检验软件参数设置



 


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查看结果,因为选中了四种统计方法,所以出现了四种统计结果来进行高斯分布的描述,我们只看一种就可以了。四种方法均显示, Passed normality test (alpha=0.05), P value summary为ns。因此,可以进行单因素方差分析了。



 


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选中数据,进行单因素方差分析



 


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这里呢,我们首先假设方差相等



 


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设定需要比较的组,或者两两比较也行


 


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方差如果相等的话就可以直接看结果了,但是方差不等,如下所示,那么我们应该假设方差不等。


 


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我们应该选择方差不等,使用Brown-Forsythe and Welch ANOVA tests。



 


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然后查看结果,看看之间的比较是否具有显著性差异。这里显示出了Significant,星号,P值等。



 


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作图,选择图形,Column,Mean/meadian&error,我们来做个基本的柱状图



 


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调色,改变标签。(不会的请看Graphpad做小提琴图和箱线图等)。



 


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进行显著性标记,模型组和空白组我们使用#表示,模型组和给药组我们用*表示,进行标记。



 


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保存Graphpad文件,保存TIFF图片,300dpi。




文章来源:转自 Paper绘图

The End

发布于:2019-12-15,除非注明,否则均为字符演示-IDDEMO原创文章,转载请注明出处。